Mobil Toyota Agya memiliki tiga varian, yaitu tipe E, G dan juga tipe TRD S. Pada tipe G dan TRD S interiornya memiliki balutan warna yang lebih semarak dibandingkan dengan tipe lainnya. Maklum karena lebih mahal harganya, jelas lebih bagus tampilannya.
Demikian pula bila melihat interior secara keseluruhan, untuk Toyota Agya tipe TRD S memiliki tampilan interior yang berbeda dengan kesan sporty lebih kuat. Perbedaan dengan tipe lainnya memang agak kentara, meskipun secara sekilas hampir sama. Hanya kesannya memang tipe TRD S ini memang dimanjakan.
Interior pada kabin mobil Toyota Agya dihiasi dengan lapisan aksen krom pada beberapa permukaan seperti pada tombol AC, pada panel list meter, lis tuas rem parkir dan tongkat transmisi serta tuas handling pintu. Pada Jok dilapisi dengan kain fabric lengkap dengan sandaran kepala yang bisa dilepas,
Dan yang lebih menarik pada semua tipe mobil Toyota Agya ini sudah dipasangi dengan SRS airbag atau balon penyelamat. Airbags ini akan mengembang saat terjadi benturan, jadi lebih aman bila terjadi kecelakaan. Ini perbedaan mendasar dengan Ayla. Ayla tidak memiliki airbag. seta Seat belt di kursi belakang pun sudah menjadi fitur standar.
Demikian pula dengan spionnya sudah elektrik, jadi bisa diatur sendiri dari dalam kabin mobil (kecuali tipe E). Ini memudahkan saat parkir untuk menghindari benturan pada kaca spion yang sering terjadi akibat tempat parkir yang sempit. Apalagi pada jalanan yang sempit, sering tidak sengaja membentur spion, karena emang posisinya yang lebih menjorok.
Sedang untuk audio pada Mobil Toyota Agya sudah mengusung audio 2 DIN yang bisa memutar CD/MP3/USB dan aux. Khusus tipe E audionya hanya 1 DIN. Memang cukup nyaman bila ingin mendengarkan musik dari flashdisk bisa langsung dicolokan ke port USB pada audio mobil. Memang ini semakin memanjakan pengguna mobil Agya.
Meskipun masuk kategori mobil mini, Agya memiliki ruang interior yang cukup lapang dan luas. Memang tidak selapang mobil MPV, namun bila dibandingkan dengan mobil mini lainnya sudah cukup lega dan nyaman. Posisi kursi juga cukup untuk kaki orang dewasa bila diisi full penuh dengan lima penumpang. Namun akan lebih baik bila empat penumpang akan terasa lebih lega.
Namun jangan khawatir bila digunakan untuk full penumpang, AC pada mobil Agya sudah cukup dingin. Ruangnya yang cukup kecil membuat ruangan cepat dingin, meskipun kondisi luar cukup panas. Memang keunggulan mobil mini dibandingkan mobil MPV tidak memerlukan blower, cukup AC depan sudah bisa mendinginkan seluruh ruangan dalam mobil. Sekalian ini dipadu dengan musik audio, maka jalanan yang macetpun bisa cukup nyaman dilalui.